Eurasian Genomic Continuity: High-Density Autosomal SNP & Archaeogenetic Modeling of Turkic Populations
1- دیتابیس:
NCBI GEO
Reich Lab / AADR (Allen Ancient DNA Resource)
HGDP & 1000 Genomes Project (NCBI SRA)
2- متدولوژی:
Autosomal IBD Segments
برنامه BEAGLE / Refined IBD برای استخراج قطعات مشترک بالای 1-5 cM برای سنجش حجم دقیق مهاجرت و خویشاوندی تاریخی
Admixture & qpAdm Modeling
پکیج ADMIXTOOLS (f3/f4-statistics & qpAdm) برای سنجش درصد اختلاط باستانی و مدلسازی جمعیت باستانی با دیتای باستانی
Admixture Dating via Linkage Disequilibrium
برنامه DATES یا ALDER برای تخمین زمان دقیق آمیزش بر حسب نسل و سال تقویمی
High-Resolution Y-SNP Subclades
3- خروجی:
تعیین سهم دقیق ژنتیکی اجداد بومی باستانی در مقایسه با فاکتورهای مهاجرتی استپ های اوراسیا
تفکیک امواج مختلف جمعیتی بر اساس طول قطعات IBD و تاریخ گذاری LD decay
رد قطعی مدل های تک بعدی صفر درصد جریان ژنی با ارائه یک مدل دموگرافیک شبکه ای و پیوسته
یک نکته:1 الی 2 سال زمان میبره
اگر به نتیجه رسید همینجا نتیجشو بهتون میگم
@Genetics_World
