Дошли руки до AlphaGenome - модель от Google, способная по последовательностям ДНК в 1 млн "букв" делать предсказания среди 11 модальностей, включающих экспрессию генов, элементы сплайсинга, состояние хроматина и карты хроматиновых контактов.
Плюсы:
- очень простой и понятный тьюториал. Для коллег, занимающихся образованием, очень рекоммендую попробовать готовые блокноты.
- для запуска ничего не надо, кроме API ключа (нет никакой проблемы получить)
- отдельные треки предсказывает очень хорошо
Минусы:
- не все обещанные треки умеет хорошо предсказывать, периодически выдает ерунду
- доступ только через API, вы не можете у себя установить и что-либо еще с ней поделать
- можно запускать небольшими регионами для исследования, целый геном в нее сразу не воткнете
- использование разрешено только в некоммерческих целях и в исследовательских задачах (для медицины нельзя)
Если более 100 страниц статьи читать не хочется, был неплохой семинар под запись, где Алена Аспидова и Вениамин Фишман, в открытой дискуссии с коллегами, разобрали статью. Как по мне, самая интересная часть в конце :)
12
2November 10, 2025 2.3K 38
