Генетика предполагает, эпигенетика располагает, а NGS помогает все… — Разговор на клеточном уровне — TG.ME

Генетика предполагает, эпигенетика располагает, а NGS помогает все это увидеть 🧬 20 августа компания «Бластим» проводит открытый онлайн-мастер-класс по анализу NGS-данных. Тема нам близка, поэтому делимся анонсом. На первый взгляд, начальный этап пайплайна анализа NGS максимально однообразен: получаем риды, базово смотрим качество, картируем на референс. Что может пойти не так? На самом деле очень многое зависит от дизайна исследования. Например, где-то мы хотим равномерное покрытие, а где-то, наоборот, стремимся к ярким пикам. В одном случае мы должны бить в набат, увидев высокий процент дубликатов, а в ином — такой результат ожидаем. Что для определенного протокола может быть важным биологическим сигналом, для другого — признаком жутких технических проблем. Хороший биоинформатик обязан ориентироваться в этой теме как рыба в воде. На вебинаре научимся читать NGS-данные и использовать разные характеристики ридов для интерпретации эксперимента. Разбираться будем на примере разных «секов» для изучения эпигенома, таких как ChIP-seq, ATAC-seq, MNase-seq, DNase-seq. Бластим пригласил спикера с невероятно богатым опытом в этой области, Александру Галицыну (ФББ, Сколтех, MIT). Не пропустите! Адженда: ➜ Всегда ли нестандартный QC-профиль — это плохо? ➜ Чем отличается работа с одним ридом и с парой? ➜ Почему картирование дает отнюдь не только координату в геноме? ➜ Какие показатели почти всегда указывают на артефакты, а когда нужно учесть метод? ➜ Как перейти от сырых данных к осмысленным выводам? Кому пригодится: всем новичкам в биоинформатике, специалистам, интересующимся эпигенетикой и логикой контроля качества. 20 августа, 19:00 мск Регистрация: https://t.me/BlastimWeb_bot?start=free_chat Если не работает, регистрация на сайте #мероприятия